Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC023590.1-203ENST00000449065 411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 UBE2D3-211ENST00000502404 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FTLP10-201ENST00000503647 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TLR8-AS1-201ENST00000451564 1349 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms