Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms