Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms