Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms