Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHBP55084 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHBP55084 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HADHBP55084 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHBP55084 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HADHBP55084 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HADHBP55084 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms