Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA2D1P54289 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms