Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRYBA4P53673 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms