Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms