Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB27AP51159 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB27AP51159 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms