Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms