Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFRP42898 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms