Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms