Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRMP28827 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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