Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms