Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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