Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms