Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms