Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGFP01133 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGFP01133 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms