Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEBLO76041 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms