Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6DO43924 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms