Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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