Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms