Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms