Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CEP290O15078 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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CEP290O15078 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CEP290O15078 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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