Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms