Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP99D6REC4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms