Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms