Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms