Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAP3K4Q9Y6R4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms