Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SNX6Q9UNH7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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