Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms