Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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USP35Q9P2H5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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