Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms