Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms