Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms