Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms