Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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