Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms