Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIRT1Q96EB6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms