Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms