Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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