Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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