Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms