Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC27Q2M243 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms