Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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