Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms