Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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