Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms