Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms