Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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